MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanosarcina mazei Go1 chromosome

Total Repeats: 24421

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_003901	AGAT	2	8	144417	144424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_003901	A	7	7	144475	144481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_003901	GA	4	8	144516	144523	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_003901	GCT	2	6	144527	144532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_003901	TCT	2	6	144561	144566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_003901	A	7	7	144586	144592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_003901	A	6	6	144598	144603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_003901	CTGG	2	8	144629	144636	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1010	NC_003901	T	6	6	145276	145281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_003901	TA	3	6	145285	145290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_003901	TAAA	2	8	145311	145318	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_003901	TA	3	6	145319	145324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_003901	AAAT	2	8	145334	145341	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_003901	A	6	6	145412	145417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_003901	ATA	2	6	145462	145467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_003901	TAAT	2	8	145498	145505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_003901	A	8	8	145506	145513	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_003901	ATTA	2	8	145519	145526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_003901	TA	3	6	145542	145547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_003901	T	7	7	145621	145627	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_003901	A	7	7	145660	145666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_003901	TCT	2	6	145704	145709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_003901	TGC	2	6	145711	145716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_003901	AAG	2	6	145728	145733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_003901	TCT	2	6	145737	145742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_003901	TTTC	2	8	145755	145762	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1028	NC_003901	TCTT	2	8	145793	145800	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_003901	ATT	2	6	145854	145859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_003901	AGGA	2	8	145948	145955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_003901	ATA	2	6	145994	145999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_003901	ATA	2	6	146015	146020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_003901	ATA	2	6	146036	146041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_003901	ATA	2	6	146057	146062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_003901	A	6	6	146088	146093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1039	NC_003901	CTT	3	9	146261	146269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_003901	TGC	2	6	146278	146283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1042	NC_003901	TCTTT	2	10	146314	146323	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1043	NC_003901	T	6	6	146351	146356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1047	NC_003901	AGAA	2	8	148402	148409	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_003901	ATA	2	6	148482	148487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_003901	A	6	6	148530	148535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1051	NC_003901	TGTTT	2	10	149728	149737	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_003901	CTT	2	6	149749	149754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_003901	T	6	6	149922	149927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003901	TTC	2	6	150023	150028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1056	NC_003901	T	6	6	150156	150161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1058	NC_003901	TA	3	6	150170	150175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_003901	TAA	2	6	150198	150203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_003901	TTA	2	6	150205	150210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_003901	T	6	6	150261	150266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_003901	A	7	7	150284	150290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_003901	A	6	6	152799	152804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_003901	CAT	2	6	152817	152822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_003901	TCG	2	6	152854	152859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_003901	TC	3	6	152884	152889	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_003901	CTG	2	6	152908	152913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_003901	CTG	2	6	152936	152941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_003901	T	6	6	152971	152976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_003901	TCCT	2	8	153033	153040	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_003901	T	7	7	153054	153060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1072	NC_003901	TC	3	6	153086	153091	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1073	NC_003901	ATGA	2	8	153109	153116	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_003901	TA	3	6	153120	153125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_003901	TAATAT	2	12	153137	153148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1080	NC_003901	AAT	2	6	154803	154808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_003901	GAAAG	2	10	154825	154834	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1083	NC_003901	A	7	7	154877	154883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_003901	T	6	6	154910	154915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1086	NC_003901	AAT	2	6	154952	154957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1088	NC_003901	A	7	7	155028	155034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_003901	A	8	8	155062	155069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_003901	AG	3	6	155164	155169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_003901	ATTAA	2	10	155193	155202	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_003901	TAA	2	6	155238	155243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1094	NC_003901	AT	3	6	155334	155339	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1099	NC_003901	TAAA	2	8	155920	155927	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_003901	A	7	7	155925	155931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_003901	A	6	6	155987	155992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_003901	TA	3	6	160805	160810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_003901	A	6	6	160824	160829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_003901	CCAT	2	8	160899	160906	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1105	NC_003901	TA	3	6	160919	160924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_003901	TA	3	6	160934	160939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_003901	TACA	2	8	160957	160964	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_003901	TA	3	6	160966	160971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_003901	TA	3	6	160984	160989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_003901	T	6	6	161073	161078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_003901	TA	3	6	161100	161105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_003901	ACCTG	2	10	161112	161121	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1113	NC_003901	GAG	2	6	161134	161139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_003901	A	6	6	161178	161183	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_003901	AGGA	2	8	161185	161192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_003901	AGGATA	2	12	162228	162239	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_003901	TTTCTC	2	12	162389	162400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_003901	CTGCC	2	10	162417	162426	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1119	NC_003901	TATT	2	8	162530	162537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_003901	TAA	2	6	162548	162553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_003901	TA	3	6	162554	162559	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_003901	AAAG	2	8	162571	162578	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_003901	GAA	2	6	162585	162590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_003901	A	6	6	162589	162594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_003901	T	7	7	162633	162639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_003901	TACA	2	8	163467	163474	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_003901	T	6	6	163479	163484	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_003901	AT	3	6	163485	163490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_003901	AAAC	2	8	163502	163509	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_003901	A	6	6	163531	163536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_003901	TTG	2	6	163555	163560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_003901	T	7	7	163574	163580	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_003901	ATT	2	6	163582	163587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_003901	AGCGA	2	10	163642	163651	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1135	NC_003901	TGC	2	6	163764	163769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_003901	T	6	6	163825	163830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_003901	TGT	2	6	163867	163872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_003901	ATTT	2	8	163979	163986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1139	NC_003901	TGCAGG	2	12	164047	164058	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1140	NC_003901	AAAT	2	8	164091	164098	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1141	NC_003901	AT	3	6	164097	164102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1142	NC_003901	AGAAA	2	10	164104	164113	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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1152	NC_003901	AT	3	6	164878	164883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1178	NC_003901	ATG	3	9	170259	170267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1270	NC_003901	TAA	2	6	177813	177818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1271	NC_003901	TAGTAA	3	18	177819	177836	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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1420	NC_003901	CTT	2	6	193216	193221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1421	NC_003901	GT	3	6	193284	193289	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1422	NC_003901	CT	3	6	193315	193320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1425	NC_003901	AATTA	2	10	193574	193583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1429	NC_003901	A	6	6	193825	193830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1430	NC_003901	ATA	2	6	193832	193837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1431	NC_003901	ATA	2	6	193853	193858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1434	NC_003901	T	6	6	198272	198277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1452	NC_003901	ACTC	2	8	204549	204556	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1456	NC_003901	TCT	2	6	205491	205496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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